Z Letiska M. R. Štefánika je možné pravidelnými leteckými linkami letieť do/z týchto destinácií: 

Alghero, Birmingham, Burgas, Dublin, Edinburgh, Korfu, Londýn (Luton, Stansted), Malaga, Malorka, Manchester, Pafos, Split, Sofia, Solún

UPOZORNENIE: Pred odletom do Grécka, na Cyprus je potrebné vopred vyplniť online formulár, inak nebude cestujúcim umožnený odlet. Podmienky vstupu do krajín nájdete tu. Budova letiska sa otvára 2,5 hodiny pred odletom. 

Burgas, Sofia - po prílete na Slovensko je potrebné kontaktovať regionálny úrad verejného zdravotníctva, zotrvať v domácej izolácii a na 5. deň absolvovať test na koronavírus.

Pravidelné lety do iných destinácií nie sú dopravcami plánované, alebo sú vládou SR zakázané. Dátum umožnenia letov z/do iných krajín (Ukrajina, Turecko, Egypt, Tunisko, Rusko, Spojené arabské emiráty, Severné Macedónsko a iné) nie je známy.